Sollte es eine Steuer auf umweltverschmutzende Technologien geben, auch wenn diese den technologischen Fortschritt fördern?

Gibt es doch bereits. CO2 Steuer zum Beispiel.

Generell macht sowas aber immer nur dann Sinn, wenn es auch alternative Technologien gibt, die so gefördert werden können.

Das bremst auch nicht den technischen Fortschritt. Es lenkt ihn nur in eine Richtung. (Wenn man es mit Feingefühl macht.)