Eine Probezeit ist für beide Seiten da - also auch für dich, damit du feststellen kannst, ob der Job und die Rahmenbedingungen für dich passen. Daher ist es völlig legitim, wenn du dich auf einen neuen Job bewirbst.
Es ist aus Datenschutzgründen nicht erlaubt, sich einfach so bei deinem derzeitigen Arbeitgeber nach dir zu erkundigen, also mach dir da keine Gedanken.
Hast du denn in deinem bisherigen Lebenslauf sonst auch schon häufig nach kurzer Zeit gewechselt? Wenn nicht, käme man nicht auf die Idee, dass du es dir ständig anders überlegst oder illoyal bist. Wie gesagt, dafür ist die Probezeit ja da. Wenn du in der Richtung Bedenken hast, stelle in deinem Lebenslauf Dinge heraus, die du schon lange machst, z.B. Hobbies, Vereinsmitgliedschaften o.ä.
Außerdem kannst du das Thema auch offen in deiner Bewerbung ansprechen. Sag ehrlich, dass du die Belastung durch die Pendelei unterschätzt hast und dass dir fünf Stunden Fahrt am Tag einfach zu viel sind. Der Job gefällt dir ja grundsätzlich. Daher kann der neue Arbeitgeber durchaus vermuten, dass du schon allein deswegen bleibst, weil es viel näher ist.
Zieh aber lieber nicht über deinen alten Arbeitgeber her, sag nichts Schlechtes über Führungskräfte oder Kollegen, sonst könnte der neue denken, dass du bei den nächsten Schwerigkeiten auch bei ihm kündigst. Das gilt insbesondere, wenn es dein erster Job ist.
Wünsche dir viel Erfolg!