Wieso verläuft die DNA-Polymerase bei der PCR in 3'-5' Richtung und nicht umgekehrt?
Ich schreibe in ein paar Tagen eine Bio-Klausur und muss dafür die Polymerase-Chain-Reaktion also die künstliche DNA-Replikation können. Das Prinzip wie die PCR funktioniert hab ich verstanden und ist ja eigentlich auch nicht allzu schwierig, allerdings versteh ich ein kleines Detail nicht: Bei der normalen DNA-Replikation setzt die DNA-Polymerase ja immer am 5'-Ende an und geht dann zum 3'-Ende. Bisher haben wir auch immer gelernt dass Polymerasen (sowohl DNA-Polymerase als auch RNA-Polymerase) grundsätzlich nur in 5'-3' Richtung arbeiten können, weshalb es bei der normalen Replikation ja auch die Okazaki-Fragmente gibt. In meinem Unterlagen und auch auf Wikipedia steht jetzt jedoch, dass die Polymerase bei der PCR am 3'-Ende ansetzt, also genau in die entgegengesetzte Richtung arbeitet.
Hab ich das Ganze jetzt einfach nur falsch verstanden oder ist das wirklich so, und wenn ja warum läuft es hier anders ab? Hier auch nochmal der Wikipedia-Link, den ich meinte: https://de.wikipedia.org/wiki/Polymerase-Kettenreaktion#Theoretischer_Ablauf (unter 3. Elongation, der 2. Satz: "Sie beginnt am 3'-Ende des angelagerten Primers"
Schon mal Danke für alle Antworten ;)
1 Antwort
Das ist von 3' in 5' Richtung. Der Primer hat ein 5'-Ende und ein 3'-Ende. An den Primer baut die DNA-Polymerase weitere Nukleotide an. Wenn sie am 3'-Ende ansetzt, dann arbeitet sie ja von 5' nach 3' und nicht von 3' nach 5'. Der Primer wird ja verlängert.
Ich weiß nicht ob das so verständlich genug geschrieben ist.
Primer: 5'----3'
Nun setzt die DNA-Polymerase an:
5'----3'(Poly)
Sie synthetisiert nun nach rechts:
5'--------------------3'(Poly)
Also hat sie von 5' nach 3' synthetisiert.
Vielleicht ists so besser verständlich.
Ja genau, die Polymerase setzt sich fast ans Ende des 5'-Endes des DNA-Strangs (sie kann nicht ganz ans Ende, denn da ist ja schon der Primer im weg). An den Primer lagert sie sich dann aber am 3'-Ende an und synthetisiert dann ja an diesem quasi weiter - in 5'-3' Richtung.
Also die Polymerase arbeitet doch in 5'-3' Richtung und setzt auch am 5'-Ende des DNA-Stranges an, an dem sich jedoch aufgrund der komplementären Stränge das 3'-Ende des Primers befindet.
Bitte sag mir, dass ich das richtig verstanden hab, und es nur aufgrund der Formulierung miteinander verwechselt habe :D