Frage zu Hybridisierung (Gensonden)?
Es ist doch so, dass die DNA erst denaturiert wird, und sich dann die Gensonden an die einsträngige DNA anlagern können, wenn es wieder kalt wird. wie schaffen die das überhaupt so schnell, ich meine, wenn die DNA wieder kalt wird, können sich die Stränge doch wieder zusammen tun, bevor die Gensonden eine Chance haben, sich auch anzulagern... oder?
1 Antwort
Tolle Frage, die zeigt, dass du dir wirkliche Gedanken zum Thema gemacht hast!
Deine Feststellung ist durchaus korrekt. Es ist absolut wahrscheinlich, dass nicht an allen potenziellen Bindungsstellen auch Sonden binden. Tatsächlich ist auch keineswegs gewährleistet, dass die DNA an allen potenziellen Bindungsstellen überhaupt denaturiert wurde. Zudem können viele Sonden auch Off-Target also an einer völlig unsinnigen Stelle binden.
Es handelt sich aber um einen stochastischen Prozess d.h. es geht hier um Zufall. Man wirft einfach sehr viele Sonden auf sehr viel DNA und die Wahrscheinlichkeit ist ausreichend hoch, dass zumindest bei vielen Zellen auch ein Großteil der Bindungsstellen getroffen wird. Wegen eben dieser Unsicherheit, genügt es auch nicht unbedingt nur ein einziges Experiment bei einer einzigen Zelle durchzuführen, um ein eindeutiges Ergebnis zu erhalten.
Fakt ist aber auch, dass die relativ kleinen Sonden in der Regel viel mobiler sind als ein großer DNA-Strang. Insofern haben die Sonden gute Chancen (wenngleich keine Gewissheit besteht), vor der Renaturierung zu binden.
