Das hängt von deinem Ziel ab. Wenn dein Ziel Gewichtsverlust ist, dann ist ein Kaloriendefizit richtig. Damit kann natürlich auch etwas Muskelschwund einhergehen, wenn du deutlich zu wenig isst. Vielleicht verlierst du dann so viel Fett, dass auch deine Bauchmuskeln zum Vorschein kommen.
Wenn du knapp 1000 Kalorien unter deinem Bedarf bist, ist das eindeutig viel zu wenig und du verlierst auch Muskeln. Wann man Kalorien aufnimmt, da gibt es natürlich viele Meinungen. 1000 Kalorien am Abend sind aber sehr viel, versuche lieber tagsüber mehr zu essen, dann kannst du nachts auch besser schlafen.
Versuche ein leichtes Defizit, tagsüber mehr essen und beim Sport gut trainieren.