Kann mir einer 2 Isostere für CO3^2- nennen?

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Sulfat und Phosphat passen nicht, wie du schon sagst.

Nitrat aber. Sulfit könnte man auch nennen, wobei da streng genommen die Geometrie nicht übereinstimmt.

Borat BO₃³⁻ und mit Einschränkungen BF₃.

Beim BF₃ bin ich nicht sicher, ob beim Bor ein Elektronensextett ist oder ob doch ein bisschen ein π-Elektronensystem vorliegt. CO hat ja auch eine Dreifachbindung und eine positive Teilladung am Sauerstoff(!).