Natürlich geht es. Windows kann von allen Medien booten( egal ob CD , USB Stick, interne/externe Platte). Was ein Problem sein könnte, wäre die Geschwindigkeit, da USB nicht so schnell S-ATA ist.(Nur USB3.0 ist vergleichbar).
Und was dazu kommt: Du kannst nur von diesem Einen PC booten von dem du Windows installiert hast.