Kann es sein, dass du Adobe erst vor kurzem neu installiert hast oder so?
Es klingt so als wäre die Voreinstellung, welche Datein automatisch mit Adobe Reader (oder welchen Reader du benutzt) assoziiert werden sollen falsch.. Das solltest du aber eigentlich leicht beheben können indem du diese Einstellungen änderst..
sollte garnichts funktionieren den Reader mal desinstallieren, neu drauf und dann bei den Einstellungen während der Installation aufpassen.
Wenn du sagst es sind immer noch "Anwendungen" meinst du, dass sie ihre alte Dateiendung behalten haben , richtig? Sollte jedenfalls mit der oben genannten Lösung klappen.. da ich eben nicht weiß welches Programm zu zum Öffnen verwendest, kann ich dir nicht sagen wo du die genannten Einstellungen finden kannst..