Hallo YoungWoman21!
Das ist eine gute Frage. Ich denke, dass Molly, wie mein Vorgänger schon bemerkt hat, in ihn verschossen ist und Sherlock deshalb etwas unschlüssig ist, was er damit anfangen soll bzw. sich Molly gegenüber verhalten soll.
Außerdem ist John inerhalb mehrerer Jahre ein sehr guter Freund an Sherlocks Seite geworde. Sie teilten sich schließlich sogar eine Wohnung.
Zudem munkeln sogennannte Sherlockians, dass der Ship "Johnlock" (sprich: Sherlock & John = Liebespaar), seit sich Moffat in einem Interview geäußert hat, dass ein, wie er es nannte, Wunsch in Erfüllung wird und einer der Charaktere sein Liebesleben völlig auf den Kopf stellt.
Bewahrheitet sich diese Vermutung, würde das Sherlocks Reaktionen zu Molly, Johns Umzug, Mary etc. erklären.
Ansonsten würde ich denken, dass Sherlock, auch wenn er Molly vertraut und ihre Hilfe benötigt, sich bei John einfach geborgener fühlt und er John wie eine Art "anderer Mycroft" sieht.
Das wären meine Schlüsse.
Ich hoffe, ich konnte helfen!
GLG SweetSecret14