Also du möchtest ein Dual-boot System erstellen?
Genau vor dem Problem stand ich vor einer Weile auch. Bei mir hat es nur so funktioniert:
Ich musste das Komplette System Frisch aufsetzen und habe dann direkt 2 Partitionen auf der Systemfestplatte gemacht(Ganz wichtig). 50GB für Linux und den Rest für Windows (250GB SSD). Dann habe ich mir einen Bootable USB Stick mit Linux gemacht, denn mit einer CD hat es garnicht funktioniert.
Dann konnte ich erst auswählen, ob ich es neben Windows installieren will.
Ich glaube es gibt sogar die Möglichkeit diesen Punkt zu überspringen und die zweite Festplatte(also die andere Partition) zu nutzen