Sind indigenen Ethnien das gleiche wie Ureinwohner?

Ja, das wird so gesehen. Aber der Begriff "indigen" ist eigentlich falsch, zumindest "unglücklich" gewählt. Er diskriminiert die Bewohner Südasiens, die (wahren) Inder. Die "Ureinwohner" z.B. von Bolivien haben mit "Indien" bzw. indigen nichts zu tun - auch wenn sie bei uns als "Indios" bezeichnet werden. Es müsste allgemein besser: autochthone Bevölkerung heißen.