Fall der Adobe Reader als Standardprogramm zum Öffnen von PDF-Dateien eingestellt ist kannst du in die Commandline einfach den absoluten Pfad zur Datei eingeben.
Mir ist nicht ganz klar weshalb du die Datei erneut speichern willst aber jedenfalls gibt es laut Adobe Reader Dokumentation keinen Parameter dafür, der per CMD übergeben werden kann.
Vielleicht reicht es ja auch aus, die Datei lediglich zu Verschieben. Dafür kannst du den MOVE Befehl verwenden.