Die Antworten mit der Werbung stimmen zwar, aber es fehlt die Information, dass Popup-Fenster eben nicht IMMER Werbung beinhalten, sondern auch manchmal wichtige Informationen einer Seite.
Ich kenne das zum Beispiel bei "Privaten Nachrichten" - wenn einem jemand etwas geschrieben hat, dann kann auf manchen Seiten/Foren auch ein solches Popup-Fenster aufgehen.
Deshalb sollte man einen Popup-Blocker auch so einstellen, dass er je nach Seite eben Popups zulässt oder nicht. Generell verbieten ist nicht die beste Lösung.