Dass der Arzt keinen Knochen sieht, halte ich für äußerst unwahrscheinlich.Er sieht vlt. keinen Bruch oder den Knochen nicht "scharf" (auch ein Röntgengerät muss eingestellt werden). Sähe er gar keinen Knochen, wäre er irgendwie rausgekommen. Ein Vitamin-D-Mangel kann zwar u.a. Osteoporose uvm. begünstigen, aber selbst mit Osteoporose im Endstadium (was deine Oma sicherlich gemerkt hätte) sieht man noch einen Knochen im Röntgen.
Aber bevor du dir Sorgen machst und quer im Internet postest, solltest du noch einmal mit deiner Oma reden bzw. die und/oder du mit dem Arzt. Der hat schließlich Medizin studiert ;-)