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Bis heute ist sich die Wissenschaft nicht ganz darüber im Klaren, welche der Substanzen im Kaffee abführend wirken. Das Koffein kommt aber dafür nicht in Frage, es wirkt eher harntreibend.
Man geht davon aus, dass es bestimmte Röststoffe im Kaffee sind, die den Stoffwechsel im menschlichen Körper, und somit auch die Darmtätigkeit anregen.
Die im Darm befindliche, verdaute Nahrung wird durch den Kaffee scheller zum Darmausgang (After) transportiert. Man merkt dann oft, dass man z.B. morgens nach dem ersten Kaffee ziemlich schnell für einige Minuten aufs Klo muss.