Die Trafos können nur zerstört werden, wenn sie zuviel belastet werden (z.B. durch einen Kurzschluss, es gibt auch kurzschlussfeste Trafos, z.B. Schweisstrafos). Bei einer "Unterbelastung" passiert nichts. Ein vergleichbarer Gegenstand wäre der PKW. Du zerstörst ihn ja auch nicht, wenn du nicht die ganze Zeit die Höchstgeschwindigkeit fährst.
Zu den LEDs: Die LEDs müssen für diese Spannung ausgerichtet sein. Auch muss die Spannungsart stimmen (das heisst, bei Gleichspannung LEDs muss der Trafo auch Gleichstrom (DC) liefern). Ansonsten zerstörst du sie. ;)