Du hast da was grundsätzlich falsch verstanden, itachi war nicht willkommen im Dorf, er wurde sogar gejagt. Die breite Öffentlichkeit wusste nichts von der Unzufriedenheit des uchiha clans und auch nichts von dem geplanten Putsch. Natürlich wusste auch niemand das die Auslöschung des clans seine Mission war. Itachi wurde nach der Tat als Verräter und Mörder betrachtet, der seine eigene Familie umgebracht hat. Die einzigen die die Wahrheit kannten waren der dritte hokage, danzo, die anderen zwei alten Menschen und obito, sonst niemand. Itachi hat sich geopfert. Zum wohle des Dorfes und für seinen Bruder.
Itachi holte sich dann obitos Hilfe um den clan zu beseitigen, dafür musste er sich dann aber akatsuki anschließen. Itachi war einverstanden, denn so konnte er gut spionieren. Zu dem Deal gehörte auch obitos versprechen, konoha in Frieden zu lassen. Deshalb kam es nicht schon früher zu einem Angriff auf das dorf.
Als kakashi zum sechsten hokage wurde hat er itachis Namen als Mörder usw aber aus den Geschichtsbüchern streichen lassen soweit ich weiß. Dennoch, auch in boruto weiß die breite Masse nichts von dem was sich im Hintergrund abgespielt hat.
Der dritte hokage aber wusste natürlich das itachi nur seine Pflicht erfüllt hat und hat deshalb das passwort der barriere nicht geändert, damit itachi jederzeit vorbei kommen kann um nach seinem Bruder zu sehen.