Ich vermute, da sie nur Luzifer brauchten, ihn isolierten. Chuck sprach ja auch davon die Finsternis aufhalten zu wollen/können und die Erzengel dazu am besten geeignet wären.
Da von den Erzengel nur noch Michael (neben Luzifer) über ist, der aber zu angeschlagen... dass sie Luzifer isolierten und somit er alleine im Käfig war.