Otaku bedeutet ist ursprünglich eine höfliche Bezeichnung für jemandes Haus. Also wenn ich beispielsweise sagen wollte "Ihr Haus ist aber schön", würde man im höflichen japanisch "otaku" verwenden.
Nun gab es ca. in den 80er Jahren junge technikbegeistere Japaner, die nicht das soziale Feingefühl hatten, um die komplizierte Höflichkeitssprache des japanischen zu benutzen (es ist viel komplizierter als nur "du" oder "Sie" wie im deutschen). Stattdessen haben die dann einfach immer "otaku" als Personalpronomen für die Anrede benutzt. Aus dieser Marotte wurde dann schließlich eine Bezeichnung für diese Leute. Dabei bezeichnet Otaku einfach nur eine Person, die irgendein Hobby sehr ausgiebig, oder fast schon obsessiv, betreibt. Es gibt also nicht nur Anime/Manga-Otakus, sondern auch Eisenbahn-, Militär- und Angelotakus.
Der Otaku-Begriff hat seit seiner Entstehung eine sehr interessante Bedeutungswandlung erfahren. Anfangs wurde er mit Verwunderung für technisch versierte junge Japaner verwendet, dann aber wegen des bereits angesprochenen "Otaku-Mörders" sehr negativ konnotiert. Die angebliche Videosammlung voller Schmuddelfilme und Horror/Slasher-Filmen des Mörders soll angeblich nur von Reportern "inszeniert" worden sein. Man hat vermutlich ähnlich wie bei der Killerspiel Debatte in Deutschland einen Sündenbock gesucht.
Durch den Boom der japanischen Populärkultur, welche größtenteils die Kultur der Otakus ist, d.h. Anime, Manga, Videospiele usw., wurde die Bezeichnung als Otaku langsam wieder etwas positiver gesehen. Selbst die japanische Regierung versucht dieses Image vom "Cool Japan" im Ausland zu propagieren und zu verbreiten.
Tatsache ist aber auch, dass Otakus immer noch etwas Negatives anhaftet. Sie werden tendenziell eher als seltsam oder freakig betrachtet und jemanden als Otaku zu bezeichnen, oder so bezeichnet zu werden, ist nicht gerade ein Lob. Im Westen hingegen, also bspw. Deutschland, bezeichnen sich einige Enthusiasten mit Stolz als Otaku, kehren also den eigentlich eher negativen Begriff ins Positive um. Nur solltest du dich in Japan nicht unbedingt so präsentieren. ;)