Im training set sind 150 Samples vorhanden und für jedes Sample RNA-seq Daten für 10,000 gene. Jedes Sample is als Stammzelle oder als nicht-Stammzelle gelabled. Möchte nun für testing set vorhersagen welche Samples Stammzell-Samples sind, basierend auf Expressions-Daten für dieselben Gene. Welche Modelle wären hier am besten geeignet? Logistic Regression, Random Forest? Vielen Dank für eure Antworten!

Wie kann man eine differenzielle Genexpressionsanalyse auf der Grundlage der verabreichten Medikamentenmenge durchführen, indem man die Medikamentenmenge als kontinuierliche Variable verwendet, anstatt die Proben in behandelte/unbehandelte Gruppen zu unterteilen, wie im Standard-Deseq2-Workflow?