Es gibt jetzt eine Lösung!
1. Die alte App deinstallieren
2. Von Safari aus auf https://emu4ios.net/view.php?name=GBA4iOS gehen und auf den "Get"-Button drücken. Bei Nachfrage auf "Installieren" drücken.
3. Nachdem die App installiert wurde und auf dem Home-Bildschirm erscheint, in die Einstellungen unter Allgemein > Profile dem Entwickler vertrauen.
Jetzt kann man die App auch schon benutzen!
P.S.: Diese Anleitung funktioniert für alle Versionen von iOS bis einschließlich iOS 10.2 .