Ich spiele auch Querflöte und (Tenor) Saxophon und es klappt. Beide Instrumente haben ihre Unterschiede, doch auch wenn du schnell zwischen den Instrumenten wechselst, dann funktioniert das nach einer Weile ganz gut. Du musst eben nur lernen, die beiden Instrumente als Individuen zu erkennen, also auf der Querflöte geht der Griff so und auf dem Saxophon anders. Aber viele Griffe sind gleich, sodass du Theoretisch nur den Ansatz neu erlernen must. Ist ganz einfach, wenn man sich ein bischen damit auseinandergesetzt hat.
Viel Glück, wenn du es doch ausprobierst. ;)