Alternativ könntest deine schiefen Scans einfach mit OCR (Texterkennung) automatisch ausrichten.

Adobe Acrobat Pro --> Unter Anzeige, Werkzeuge, Texterkennung, In dieser Datei.

https://acrobat.adobe.com/de/de/acrobat/acrobat-pro.html

PDF-XChange Editor --->Convert, Text erkennen, Art der Ausgabe: Neues durchsuchbares PDF-Dokument erstellen, Häckchen bei "Automatisch Entzerren"

https://www.tracker-software.com/product/pdf-xchange-editor/download?fileid=613

Vorher Language Pack installieren

https://www.tracker-software.com/pdf-xchange-viewer-ocr

Es gibt auch eine kostenlose Software womit man automatisch Scans ausrichtet.

http://scantailor.org/downloads/

Viel Spaß