Hallo,
also zu allererst: "[...]BackTrack Linux is no longer being maintained." Heißt es wird nicht weiter unterstützt. Aber es gibt auch schon eine weiterhin aktiv entwickelte Alternative namens Kali Linux (einfach googlen).
Als nächstes frage ich mich, weshalb jemand, der nicht mal eine Ahnung hat, wie er eine Linux Distribution installiert ein Backtrack/Kali System braucht. Naja, das sei mal dahingestellt.
Wenn du dich wirklich mit Linux befassen und lernen willst, wovon ich mal ausgehe wenn du ein Backtrack willst, dann rate ich dir, du fängst an dir Antworten selbst zu suchen. Nicht böse gemeint, aber vorallem am Anfang werden dir viele Probleme entgegenkommen, die sicher schon zig Leute vor dir hatten und demnach zu Hauf im Internet beantwortet sind. Das spart dir, aber auch vielen anderen viel Zeit.
Zu deiner Frage, ja es ist möglich, ein drittes(viertes....) Betriebssystem beim Booten zur Auswahl zu haben. Jedoch wird dazu ein anderer Bootloader als der von Windows nötig. Deine Wubi Installation trägt sich nämlich schlicht in den Bootloader von Windows mit ein, statt einen eigenen zu installieren. Dieser ist jedoch bei den meisten Distributionen Teil der Installation, da solltest du dir also keine Sorgen machen. Wie man ein Kali System installiert siehst du hier:
http://www.youtube.com/watch?v=oC_-8o2ZJSg
Wobei sich die Installation nicht arg von anderen Linux Distributionen mit grafischem Installer unterscheidet.
Ich hoffe das war jetzt nicht zu viel Information auf einmal für dich :P