Also die Enden werden durch die Wahl deiner Fraktion bestimmt. Diese Fraktionen gibt es: 

• Die Stählerne Bruderschaft (militärisch organisierte Rassisten in großen Roboterrüstungen, die alles nichts menschliches vernichten wollen)
• Die Minutemen (Ein Haufen Bauern, die für das Wohl des Staates kämpfen)
• Die Railroad (Eine Untergrundorganistion, die versucht, Synths(Androiden) zu retten)
• Das Institut (Erschafft die Synths damit sie für das Institut Sklavenarbeit verrichten. Das Institut ist der Bösewicht in dem Spiel) 

Es gibt zwei Arten von Enden in Fallout 4. Das erste Ende geschieht, wenn du dich für alle Fraktionen außer dem Institut anschließt. Dabei wird das Institut atomgebombt. Beim anderen schließt du das Ende mit dem Institut ab und tötest die Railroad und die Stählerne Bruderschaft. Die Railroad wird meistens getötet. Wenn du das "friedlichste" Ende haben möchtest, dann wähl die Minutemen.