TIF kann auch Transparenzen (muss in den Speicheroptionen angewählt werden). Ohne Pfade muss einfach alles, was transparent sein soll, in der jeweiligen Ebene ausgewählt und gelöscht (bzw. mit Maskierungebene schwarz) sein.
Es darf keine Hintergrundebene vorhanden sein! Pfade musst du zuvor als "Beschneidungspfad" machen, damit diese im Layoutprogramm erkannt werden. Die Dateigröße wird mit TIF immerhin etwas kleiner als mit PSD. Um noch Speicherplatz zu sparen, kannst Du die Bilder vorher schon auf die später benötigte Bildgröße runterrechnen.
GIF + PNG kann zwar auch Transparenzen, ist aber immer mit Qualitätsverlust, außerdem kannste soweit ich noch weiß, keine Pfade mit exportieren.
Viel Erfolg!