Das ist eine ziemlich spezifische Frage. Sicherlich könnte das gehen. PHP hat kein Problem, den Inhalt von Dateien zu lesen und auch aneinander zu hängen.
Ich weiß nicht, wie WAV Dateien aufgabaut sind, aber sicherlich haben sie soetwas wie ein Header und dann den Inhalt. Beim zusammenfügen müsstest du halt beachten, dass nur EIN Header übernommen wird. Was du bei unterschiedlichen Header machst, musst du selber rausfinden... einfach wird es jedenfalls nicht. Hier wird das wohl auch niemand aus dem Kopf wissen, musst halt mal im Internet gucken, wie der Aufbau einer WAV Datei spezifiziert ist.