Du hast die Systemwiederherstellung für die externe Platte aktiviert. Man kann diese gezielt für diese Platte deaktivieren. Dann wird der Platz freigegeben und der Ordner bleibt leer.

Hier gibts eine schöne Anleitung http://www.supernature-forum.de/tutorials-and-tipps/108084-speicherbelegung-der-systemwiederherstellung-anpassen-unter-windows-7-a.html