Hatte das gleich Problem, in meinem Fall waren die Zahlen von Überschrift 1, 2, 4 und 5 Fett, von 3 jedoch nicht. Über "Formatvorlage ändern" konnte es nicht behoben werden. Als Lösung hat folgendes funktioniert:

Einfach die Zahl der Überschrift X direkt im Dokument markieren und dort mit der "normalen" Textformatierung auf FETT setzen, dann wurde das sofort auch in der Menüleiste bei den Formatvorlagen übernommen und alle Überschriften (in meinem Fall der Kategorie 3) im Dokument mit fetten Zahlen dargestellt.