Die Erklärung ist ziemlich umfassend deshalb lies hier nach. http://tinyurl.com/2k2u7y

Der Ausdruck bedeutet, schlau und gerissen zu sein. Für seine Herkunft gibt es verschiedene Erklärungsversuche (http://www.dradio.de/dlr/sendungen/kopfnuss/180879/):

Nach einer alten medizinischen Theorie saßen hinter den Ohren Drüsen, die als Auffangbecken und Ausscheidungsorgan des Gehirns galten. Dicke Wülste wurden dabei als große Ansammlung von Durchtriebenheit, Schalk, List und Verschlagenheit betrachtet.

Nach einer volkstümlichen Ansicht war die Stelle hinter den Ohren Sitz geistiger Fähigkeiten, insbesondere der Schlauheit. Sehr dicke Wülste wurden als Anzeichen für einen hohen Grad von Verschmitzheit gedeutet.