Über die Abkürzung von "seines Erachtens" findet sich sehr wenig Information. Das Digitale Wörterbuch der deutschen Sprache hat diesbezüglich ein paar Beispiele (auch von "u.E" als Abkürzung für "unseres Erachtens".

Bei "s.E." dürfte es nicht um eine gängige Abkürzung handeln, entsprechend solltest du berücksichtigen, dass Leser deines Textes mit ihr nichts anfangen können.

Solltest du "s.E." im Text dennoch (vielleicht sogar mehrmals) verwenden wollen, wäre bei erstmaligem Aufscheinen eine Fußnote hilfreich (etwa: s.E. - Abkürzung für seines Erachtens; analog zu m.E.). Damit könntest du in weiterer Folge andere derartige Abkürzungen verwenden ("u.E.", "i.E" usw) - die Leser wären dann bereits gebrieft.