Naja, da die Grenzen, gerade zu unseren Nachbarn offen sind, wird dort in der Regel nicht kontrolliert. 

Stichprobenartig wird natuich weiterhin kontrolliert, sowohl von der Polizei, als auch vom Zoll.

Auf Grund der ganzen Fluchtlingslage kann es aber sicher häufiger zu Kontrollen kommen. Eher aber bei der Ausreise. Ebenfalls sind die Niederlande nicht nur bei den Reisenden, sondern auch beim Zoll für ihre Drogenpolitik bekannt, ... 

Das du sowohl in Holland, als auch in Deutschland einen gültigen Pass bei dir tragen musst, scheint dir ja bewusst zu sein. 

Also kurz gesagt, es bleibt ein Glücksspiel. Im Zweifel Zeit für die Polizei einplanen. Flixbus selbst kontrolliert nur das Ticket.