Für Spigot werden viel mehr Plugins entwickelt.
Was aber der grösste Unterschied ist ist, dass man einen BungeeCord (Proxy) Server verbinden kann. Das wird benötigt, dass ein Spigot Server auch bei 1000+ Spieler flüssig läuft. Da sich die Spieler somit auf mehrere Unterserver (Spigot) verteilen können. Man tritt der Proxy bei und diese teilt dich dann einem Unterserver zu.
Ein Unterserver könnte die Lobby sein, ein anderer ein BedWars Server und wiederum ein anderer könnte ein CityBuild Server sein.
Die Proxy leitet die Spieler also von Unterserver zu Unterserver. Die Proxy selbst hat keine Welt, worauf man spielen kann.