Hallo,
Das ist eine ziemlich kompizierte Geschichte, ich denke, dass du einen Lohnsteuerausgleich machen musst und das dann vom Finanzamt zurück bekommst. Ich würde dir aber eher empfehlen einen Profi zu fragen, ich kann dir mal die Seite von meinem Steuerberater geben, vllt frägst du mal dort nach, http://www.gabriel-kollegen.de.
Ich hoffe ich konnte dir helfen!
Gruß