Ich kann hier nur meine Erfahrung schildern, aber als Fachinformatikerin in Anwendungsentwickler in Baden Württemberg ist meine - zumindest schulische - Ausbildung definitiv schwerer als die der Systemintegratoren. Wir haben eine gemischte Klasse und von uns wird im Unterricht das volle Programm in den SI & AW Fächern erwartet, während die Systemintegratoren nur die Hälfte der Leistung des AW Faches erbringen müssen.
In der Abschlussprüfung wird das Niveau bei beiden jeweils so angepasst, dass dein nicht gewählter Kernpunkt weniger wiegt, aber die Schulzeit davor macht ja auch viele Noten aus :)

Ein Klassenkamerad hat mir auch mal erklärt, dass Anwendungsentwicklung generell schulisch quasi nur ein Topping auf die Systemintegration wohl darstellen soll. In der Firma selbst wirst du dich natürlich auf dein Kernfach konzentrieren.
Was das angeht ist der Schwierigkeitsgrad aber sehr schwankend von Firma zu Firma.
Einige meiner Klassenkameraden sitzen den ganzen Tag nur rum und langweilen sich, weil sie weder etwas beigebracht noch Aufgaben bekommen, andere haben schon ernste Projektverantwortungen.

Einen Job bekommst du vermutlich mit beiden recht einfach, denn die IT boomt. Es werden überall Fachinformatiker gesucht.