Du weißt ja sicherlich wie Apple mit Datenaustausch zu Drittanbietern steht. Ich habe es selbst nicht bei mir auf meine Apple Watch Series 2 Nike Edition ausprobiert, dennoch hat sie manchmal schon Probleme Trainings aus einer Drittanbieter App in die Health App zu importieren (TennisKeeper).
Ich kann mir gut vorstellen das das andersrum (von Health App zu Runtastic) noch weniger funktioniert, dennoch kannst du ja einfach mit der Runtastic App auf der Watch deinen Lauf antreten soweit ich weiss, ich benutze aber immer nur die Hauseigenen Apps, da diese eigentlich recht gut funktionieren :-)