Naja es kann viele Probleme haben. Vielleicht hast du an dieser stelle einen Effekt angewendet, der alles überlastet. After Effects cs6 ost schon etwas älter. Sowieso würde ich es mit einer neueren Version probieren z.B. cc 2014 oder höher. Versuch es dann einfach mal in einer anderen Datei zu rendern (mp4, quicktime usw.) Oder einfach media encoder, ebenfalls von Adobe. Wenn es dann nicht klappt dann weiß ich auch nicht weiter... Ich hoffe ich konnte dir helfen ;D