Was ist der Grund dafür, dass sie dich verlassen hat und wann war die Trennung? 

Diese Kündigung ist definitiv nicht rechtmäßig. Während einer Krankheit mit Krankenschein, darf dich der Arbeitgeber nicht kündigen. Danach evtl. Aber da du aus der Probezeit raus bist nur unter Einhaltung der vereinbarten Kündigungsfrist  (siehe Arbeitsvertrag) oder mit triftigen Grund, welcher eine fristlose Kündigung rechtfertigt. 

Ich würde auch zum Arzt gehen. Da Wochenende ist, dann halt morgen ins Krankenhaus.  Es muss nichts schlimmes sein, aber besser einmal mehr nachgeschaut, als einmal zu wenig. 

Ich hatte bei meiner zweiten Schwangerschaft auch bis zur 12 Woche immer mal Schmierblutungen, was sich aber als unbedenklich herausstellte.  Meine Frauenärztin verschrieb mir dann Tabletten, welche Frauen in den Wechseljahren nehmen. Mit Gelbkörperhormon. Diese sollte ich nicht Oral einnehmen, sonder Vaginal einführen. Danach wurden die Schmierblutungen schnell besser.