Das was du da beschreibst klingt als ob dein Minecraft Client die Items / Rezepte lädt, der Server aber nicht - für ihn existieren sie also nicht und er kann sie so auch nicht in euer Inventar speichern. Hast du schonmal versucht die normalen Minecraft-Items zu craften? Sowas wie eine Workbench zum Beispiel. Wenn das geht solltest du den Server überprüfen, ob er ein einfaches Bukkit-System hat, oder ob du auch beim Server Hexxit benutzt. Sollte das mit der Workbench auch nicht gehen, liegt es an deinem Client, den du in diesem Fall am besten neu installieren solltest.