probier mal mit einer Rescue CD drübezugehen:

http://www.f-secure.com/linux-weblog/2008/11/25/rescuecd-301-released/

Das ist ein bootfähiger Virenscanner. Der kann dein System sozusagen von aussen reinigen.

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probier doch erstmal ein Datenrettungstool. O&O wie oben gesagt ist eine Möglichkeit. OnTrack CD Recovery auch. Beide Programme sind in der Kaufversion allerdings sehr teuer. Eine günstigere Lösung stellt z.B. zonelink undelete dar. Das habe ich schon benutzt und bin mit den Ergebnissen sehr zufrieden.

http://www.zonelink.de/index.php?page=Product&id=3

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Zonelink Tuining Suite, Testversion gibts auf der Herstellerseite

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