Dein Semesterticket gilt. Es gibt ICs die gleichzeitig auf einem Teil ihrer Strecke auch als RE fungieren (Bspw IC Norddeich - Köln, ist von Norddeich bis Bremen auch RE). Damit hat dein Semesterticket, das für Nahverkehrszüge des ausgewiesenen Gültigkeitsbereichs gilt, auch hier seine Gültigkeit. Ausschlaggebend ist das was am Bahnsteig/ Zug steht. Wenn dort zwei Zugnummern mit einer Fahrzeit auftauchen machst du nichts falsch.

Kurz: solange du im Bereich deines Semestertickets unterwegs bist, kannst du ganz entspannt den Komfort genießen.