Beim freien Fall, wird die Masse einfach der Schwerkraft überlassen und fällt einfach ab dem Ausgangspunkt herunter.
Beim senkrechten Wurf, wirft man die Masse erst hoch, und ab dem obersten Punkt (der höher als dein Ausgangspunkt/Wurfpunkt liegt), an dem die Masse nicht mehr steigt und 0km/h hat, hast du einen erneuten freien Fall (siehe oben).
Oder kurz: beide Fälle sind unterschiedlich und benötigen daher einfach unterschiedliche Formeln :)