Massive Undertale Spoiler voraus (für den ders nicht geahnt hat xD)
Mettatons Form selbst ist ein Roboter. Wie man aber bei den Geisterhäusern erfährt ist Mettaton der Cousin von Napstablook, also ein Geist, der einen Körper bekommen hat durch Alphys. Alphys selbst spricht ihn immer mit he/ him an.
Daraus würde sich schließen lassen, dass Mettaton zu "Lebzeiten"(?) ein Mann war und dann zu einer mehr oder weniger geschlechtlosen Kreatur wurde.