Karte eines Plasmids im oder gegen den Uhrzeigersinn ablesen?

Ich habe vor mir eine Karte eines Plasmids und eine Restriktionsenzym-Schnittstelle die vom Startcodon eines bestimmten Gens (800bp Länge) 100-bp entfernt ist. Muss ich das Plasmid nun im oder gegen den Uhrzeigersinn ablesen, sonst weiß ich ja nicht von welchem Ende des Gens die Schnittstelle 100bp entfernt ist?

Answer 1

[CliffBaxter]

bidirektional. Schauen wir uns mal die Plasmidkarte von pBR 322 an:

Bildquelle: https://de.wikipedia.org/wiki/PBR322

Dann sieht man, dass es in beide Richtungen geht.

Deine Angaben sind Lagebeziehungen, die Schnittstelle kann "stromabwärts" vom Startcodon des Gens liegen, wenn das Gen 800 bp lang ist, liegt sie dann im Gen oder 100 bp vor dem Gen "stromaufwärts" vom Gen aus betrachtet.

Oft ergibt sich ein Gesamtbild, wenn man noch weitere Fragmentlängenangaben und weitere Bezugspunkte hat. LG