Dieses unlogisch wirkende Problem wird in Staffel 2 Folge 11 ("Gefahr aus der Zukunft") von Doktor Harrison Wells von der Erde 2 erklärt. Nach seinem Verständnis konnte Eobard Thawne aufgrund seiner Verbindung mit der Speedforce seine Zeitachse schützen. Dieses Phänomen wird als "Zeitachsenüberrest" bezeichnet. Je nachdem von welchem Zeitpunkt aus man sein Lebens- und Handlungsablauf betrachtet, ergeben sich immer drei wesentliche Zeitpunkte. Der erste chronologische Zeitpunkt ist der Tod von Eobard Thawne durch den Selbstmord von Eddie Thawne am Ende von Staffel 1. Der zweite Zeitpunkt ist prinzipiell überall setzbar zwischen seinem und seiner Geburt in der fernen Zukunft. Der dritte Zeitpunkt ist die besagte Geburt von Eobard Thorne. Da somit sein Tod chronologisch vor seiner Geburt geschah, ist dementsprechend der Ursprung seiner Zeitachse in der Zukunft. Da dieser Zeitpunkt aber noch nicht erreicht ist, ist Thorne auch noch nicht in die Vergangenheit gereist, um Barry Allens Mutter zu ermorden und in der Zeitperiode festzustecken. Bis zur chronologischen Geburt Eobards ist seine Existenz gesichert und er besitzt eine absolute Bewegungsfreiheit in der Zeit. Erst wenn Eobard nach seiner Geburt in der Zukunft getötet wird, ist seine Existenz getilgt.
Ich weiß, dass die Erklärung kompliziert ist, aber sie ist auf diese Weise inhaltlich logisch. Die meiste Zeit läuft die Serie chronologisch nach vorne gerichtet ab (d.h. Charaktere werden älter und entwickeln sich). Eobard Thornes Bedeutung in der Geschichte spielt, aber nicht chronologisch. Der Anfang der Serie ist das Ende seines Lebens, wohingegen jede weitere Staffel sich dem Beginn seiner Existenz nähert. Erst wenn Eobards Geburt mit der zeitlichen Veränderung durch Eddie auch chronologisch erreicht wird, hört er auf zu existieren. Daher ist es logisch, dass alle Auftritte von Eobard Thorne nach der ersten Staffel eine jüngere Version von ihm präsentieren und er somit seine Reise in die Vergangenheit und seinen daraus folgenden Tod noch nicht bestritten hat.
Eobard Thorne ist durch die vielen Zeitreisen und Zeiteingriffe zu einem Zeitrelikt geworden, da er in vielen Zeitperioden gleichzeitig existiert. Sein gesamtes Leben ist dato eine in sich geschlossene Zeitachse. Die Vergangenheit ist mit der Zukunft verbunden, wohingegen sich dadurch wieder die Vorvergangenheit durch die Zukunft ändert. Nicht ohne Grund betont er und Harrison Wells an so vielen Stellen, dass man nicht in die Zeit eingreifen sollte!
Liebe Grüße und ich hoffe meine Erklärung ist einigermaßen verständlich