Für Kinder in dem Alter ist es oft wichtig, "gleich" zu sein, in die Gruppe zu passen und möglichst nicht aufzufallen. Wahrscheinlich kommt dein Bruder gerade in das Alter, wo er sich und seine Umwelt bewusster wahrnimmt und sich Gedanken macht. Das ist völlig normal und wichtig ist hier nur, dass er nicht negativ verstärkt wird.
Ich habe es meinen Kindern immer so erklärt: Menschen haben unterschiedliche Hautfarben, genauso wie sie auch unterschiedliche Augen- und Haarfarben haben. Das eine kommt häufiger vor, das andere nicht, aber alles ist ganz normal.
Dazu kannst du noch sagen, dass seine Hautfarbe halt aus einer anderen Gegend der Welt stammt. Dort scheint die Sonne viel öfter, länger und viel stärker als in Deutschland und deshalb haben die Menschen eine dunklere Hautfarbe. Diese schützt sie vor Sonnenbrand und Hauterkrankungen, die durch zu viel Sonne entstehen. Es ist also einfach nur eine sehr schlaue Idee der Natur ;)