stempeln gehn heißt, dass man die Arbeitszeit stempeln lässt.
Ist ein Begriff aus älterer Zeit, wo es noch richtige Arbeitszeitkarten und dazugehörige Stempelmaschinen gegeben hat, die den Arbeitsbeginn und das Arbeitsende (Uhrzeit) auf die Stempelkarte gesptempelt haben.
So hat der Arbeitgeber gesehen, wann der Mitarbeiter da war und wann nicht.
Heute läuft das meist über digitale Geräte, wo nur noch ein Magnet oder eine Magnetkarte durchgezogen wird.
Der Begriff "Stempeln gehn" ist aber beibehalten worden.