Also es kommt darauf an was du sagen willst bzw. auf den Kontext

Where are you going to go? benutzt du wenn du nach dem Vorhaben, dem Plan Fragst; Wohin willst du gehen?

Where will you go? Ist glaube ich eher theoretisch, weil das will-futur eher für vermutungen oder unabwendbare Ereignisse genutzt wird, die man selbst nicht beeinflussen kann

Also ich würde going to verwenden :)