Es ist doch so:

Die Konstrukteure sind Jäger (werden ja auch als sehr kräftig dargestellt). Ihre "Lieblingsbeute" sind die Aliens. Die Aliens entstehen allerdings nur durch die Verbindung von Menschen (menschlicher DNA) und dem schwarzen "Biokampfstoff". Die Konstrukteure haben also einen Jagdplaneten erschaffen (unsere ERDE) und wollen nun den Biokampfstoff (bzw. Mutationsflüssigkeit) zur Erde bringen, damit viele Aliens entstehen und die Konstrukteure dort jagen können. Der Mensch ist letztlich nur Mittel zum Zweck. Durch den Facehugger in PROMETHEUS + Kronstrukteur DNA entsteht nun eine Alien-Königin (Ende des Films) und es Bedarf nun nicht mehr dieser Mutationsflüssigkeit, da die Königin Eier legt und somit neue Aliens entstehen können, wenn Sie einen geeigneten Wirt finden. So haben die Konstrukteure Beute ohne Ende. Wobei die Entstehung der Alien-Königin Zufall war und von den Konstrukteuren nicht gewollt. Jetzt können Sie die Vermehrung der Aliens nicht mehr steuern, was sie vorher durch Einsetzen der Mutationsflüssigkeit durchaus konnten.

Unklar bleibt für mich, was auf dem Raumschiff schief gelaufen ist, bevor die Prometheus gekommen ist. Warum war der Konstrukteur in der Stasekammer?

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@hotben:

Warum wollten die konstrukteure nun die menschheit wieder vernichten mit dem virus? was lief schief, dass das raumschiff nicht startete bevor die prometheus kam?

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