Hi,
Es kommt darauf an, was du für einen Server machst(PVP, Mod etc..).
Bei einem Netzwerk mit knappen 1000 Slots beispielsweise ein PlotServer wirst du die erste Methode brauchen. Aber ich würde alllgemein mehr Speicherplatz nehmen bzw. einen RootServer, da ein RootServer mehr leistung etc. hat(meine Erfahrungen).
Es gibt eigentlich genug Tutorials zu rootservern für Minecraft etc..